京东金条逾期违约金的计算方法为：

　　1、金条自逾期之日起计算违约天数，每日的违约金为全部待还金额的0.06%~0.15%；

　　2、具体计算公式为：违约金=全部应还未还本金*违约金比例（0.06%~0.15%）*违约天数。

　　比如：

　　在京东申请金条3000元，借款期限3个月，日利率0.04%，但是未及时还款，借款35天，违约5天；

　　那么收取30天利息，5天罚息，假设违约金比例为0.06%，当期应还违约金=3000*5*0.06%=9.00元。