长江流域极危物种“鳤”高质量染色体水平基因
九江市农业科学院于 12 月 24 日发布博文,宣布以第一署名单位联合中山大学、江西省瑞昌长江四大家鱼原种场,鳤曾是我国重要的淡水经济鱼类,广泛分布于长江流域,然而,由于环境恶化和人类活动的影响,数量急剧下降,在鳤基因组信息的缺乏是保护工作的重大障碍之一,为进一步挖掘其种质资源特征,团队成员利用 PacBio 和 Hi-C 测序数据组装了鳤染色体级别的基因组,大小为 883.1 Mb,包含 24 条假染色体,Scaffold N50 长度为 35.1 Mb,配合转录组测序数据预测了 28674 个蛋白质编码基因,并已将组装和注释数据公布到 GenBank 和 Figshare 数据库。
论文共同通讯附上参考地址